Информация о статье журнала "Информатика"
Реферат
Полный текст статьи
Алгоритм предсказания взаимодействия белков на основе структурной гомологии' Кирис Т. В. 1 , Тузиков А. В. 1

  1. Объединенный институт проблем информатики Минск, Сурганова, 6

УДК: УДК 57:007:001.891.57

Статья поступила: 10.09.2012

Реферат:

Предлагается оригинальный алгоритм предсказания взаимодействия белков, основанный на структурной схожести с экспериментально определенным интерфейсом белкового комплекса, ото-бранным из базы интерфейсов белковых комплексов. Пара свободных белков выравнивается на ин-терфейс из библиотеки белок-белковых интерфейсов. Выравнивание выполняется с помощью метода динамического программирования путем максимизации корреляции между матрицами расстояний отрезков интерфейса и белка.